Zakażenie powieścią, niezidentyfikowane Mycobacterium

Hirschel i współpracownicy (wydanie z 12 lipca) opisali przypadek śmiertelnego zakażenia niezidentyfikowanym prątkiem u pacjenta z zespołem nabytego niedoboru odporności, którego choroba klinicznie przypominała infekcję Mycobacterium avium-intracellulare. Nie powiodły się wszystkie próby hodowania przypuszczalnego prątka na podłożach stałych. W związku z tym nie było możliwe uzyskanie danych fenotypowych, chemotaksonomicznych lub serotaksonomicznych do identyfikacji izolatu. Na podstawie ograniczonej liczby testów (np. Analizy lipidów, badań wirulencji i niektórych badań nad kwasami nukleinowymi) autorzy twierdzą, że wyizolowali nowatorskie, niezidentyfikowane prątki, chociaż twierdzą, że wnioski dotyczące natury drobnoustroju muszą pozostają spekulacyjne w tym momencie.
Przydatność niewielkiego podjednostkowego rybosomalnego RNA do klasyfikacji i identyfikacji nieznanych, jak również znanych gatunków bakterii jest dobrze ustalona.2 Sekwencje sygnatur, specyficzne dla mykobakterii w rodzaju, jak również na poziomie gatunku, zostały zdefiniowane dla więcej niż 30 różne gatunki prątków.3 4 5 6 7 Niedawno zastosowano podejście wykorzystujące reakcję łańcuchową polimerazy i wymagające tylko niewielkiej liczby bakterii do bezpośredniego określenia sekwencji genów kodujących małe rybosomalne RNA podjednostki.8 Szczególnie w przypadku organizmów nieulegających hodowli, dla których nie są dostępne dane chemotaksonomiczne, określenie sekwencji rybosomalnego RNA stanowi skuteczną metodę klasyfikacji i identyfikacji.9 Biorąc pod uwagę charakterystykę związków filogenetycznych w rodzaju prątków, jak określono przez porównanie sekwencjonowania rybosomalnego RNA4, 5 i ogromną liczbę opublikowanych sekwencje sygnatur specyficzne na poziomie gatunku dla większości znanych gatunków prątków, th Określenie sekwencji nukleotydowej RNA rybosomalnego powinno pomóc w identyfikacji charakteru izolatu opisanego przez Hirschela i in.
Erik C. Böttger, MD
Institut für Medizinische Mikrobiologie, 3000 Hannover 61, Niemcy
9 Referencje1. Hirschel B, Chang HR, Mach N i in. . Śmiertelna infekcja nowatorskim, niezidentyfikowanym prątkiem u mężczyzny z zespołem nabytego niedoboru odporności. N Engl J Med 1990; 323: 109-13.
Full Text Web of Science MedlineGoogle Scholar
2. Woese CR. . Ewolucja bakteryjna. Microbiol Rev 1987; 51: 221-71.
MedlineGoogle Scholar
3. Stackebrandt E, Smida J, Kazda J.. Pierwotna struktura 16SrRNA Mycobacterium leprae: jego zastosowanie w filogenezie i rozwój sond DNA. Acta Leprol (Geneve) 1989; 7: Suppl 1: 222-5.
MedlineGoogle Scholar
4. Stahl DA, Urbance JW. . Podział między szybko i wolno rosnącymi gatunkami odpowiada naturalnym związkom między prątkami. J Bacteriol 1990; 172: 116-24.
Web of Science MedlineGoogle Scholar
5. Böddinghaus B. Wolters J, Heikens W, Böttger EC. . Analiza filogenetyczna i identyfikacja różnych serotypów M. intracellulare na poziomie molekularnym. FEMS Microbiol Lett 1990; 70: 197-204.
Crossref Web of ScienceGoogle Scholar
6. Böddinghaus B, Rogall T, Flohr T, Blocker H, Böttger EC. . Wykrywanie i identyfikacja mykobakterii przez amplifikację rRNA J Clin Microbiol 1990; 28: 1751-9.
Web of Science MedlineGoogle Scholar
7. Rogall T, Flohr T, Böttger EC. . Różnicowanie gatunków Myobacterium poprzez bezpośrednie sekwencjonowanie zamplifikowanego DNA. J Gen Microbiol 1990; 137: 1915-20.
Google Scholar
8. Edwards U, Rogall T, Blöcker H, Emde M, Bouger EC. . Izolacja i bezpośrednie oznaczanie całkowitych nukleotydów całych genów: charakterystyka genu kodującego rybosomalne RNA 16S. Nucleic Acids Res 1989; 17: 7843-53.
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
9. Ward DM, Weller R, Bateson MM. . Sekwencje 16S rRNA ujawniają liczne nieuporządkowane mikroorganizmy w naturalnej społeczności. Nature 1990; 345: 63-5.
Crossref Web of Science MedlineGoogle Scholar
(2)
[patrz też: metafolina, krwiak okularowy, salve wujaka ]